Система генетического анализа, секвенатор нового поколения GenomeLab GeXP предназначена для выполнения различных задач, включая секвенирование ДНК и анализ фрагментов, на одной платформе. Принцип работы автоматического секвенатора GenomeLab GeXP основан на применении ОТ-ПЦР с высокой степенью мультиплексности, что позволяет быстро, эффективно и с высокой чувствительностью оценить экспрессию целого набора генов. Система генетического анализа GenomeLab GeXP использует более десятка передовых инженерных решений в области лабораторной автоматизации и капиллярного электрофореза.
Широкий спектр реализуемых на системе генетического анализа (секвенаторе) GenomeLab GeXP приложений позволяет подтверждать результаты исследований одного образца различными методами.
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP позволяет проводить количественные исследования в мультиплексном формате. Секвенатор GenomeLab GeXP воспроизводимо измеряет малые, но биологически значимые изменения экспрессии генов (0.5-кратные изменения). Проведение мультиплексных реакций даёт возможность исследовать в одной лунке несколько референсных генов, анализируемые гены и внутренний стандарт, обеспечивая повышение точности и достоверности результатов секвенирования.
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP может работать с одним или двумя 96-луночными планшетами. Блок секвенатора GenomeLab GeXP, состоящий из восьми капилляров, позволяет с высокой эффективностью работать с 96-луночным форматом и даёт возможность проанализировать более чем 192 образца за 24 часа.
Система генетического анализа GenomeLab GeXP оснащена лазерами с большим сроком службы. В вертикальной части модуля детекции секвенатора регистрируется лазер-индуцированная флуоресценция. При этом выполняется автоматическая настройка положения капилляров для обеспечения высокочувствительной детекции образцов ДНК. Для возбуждения излучения инфракрасных красителей в секвенаторе GenomeLab GeXP используются диодные лазеры с длительным сроком службы. Такие лазеры более чувствительные, чем ионные аргоновые лазеры.
Встроенный в систему генетического анализа GenomeLab GeXP сканнер штрих-кода обеспечивает безошибочную идентификацию образцов. Сканер также позволяет объединить секвенатор GenomeLab GeXP с автоматизированными лабораторными станциями и автоматически вводить информацию об образцах в память системы.
Экспрессия генов
Анализ экспрессии генов используется для решения самых разных задач: разработка биомаркеров опухолей, определение «генетических подписей», анализ токсичности лекарственных препаратов, исследования стволовых клеток, геномика растений, валидация результатов, полученных на микрочипах, и т.д.
В системе генетического анализа (секвенаторе) GenomeLab GeXP используется упрощённая двухфазная мультиплексная ПЦР для амплификации сразу нескольких биомаркеров. Каждая мультиплексная реакция на секвенаторе GenomeLab GeXP проводится в присутствии референсных генов и внутреннего стандарта в каждой лунке. Такой подход позволяет снизить расход реагентов, устранить погрешности пипетирования и позволяет практически избежать проведения повторных реакций. Программный модуль секвенатора eXpress Designer позволяет легко создавать специфические панели для определённых генетических исследований.
Масштабируемая система генетического анализа GenomeLab GeXP анализирует до 30 генов в одной реакции и позволяет получать до 5 760 точек данных за 24 часа в полностью автономном режиме.
Мультиплексные возможности секвенатора GenomeLab GeXP позволяют снизить стоимость ПЦР и увеличить её эффективность. Анализ до 30 генов в одном образце существенно уменьшает затраты и время исследования в пересчёте на один ген.
Система генетического анализа (секвенатор) GenomeLab GeXP обеспечивает непревзойдённую линейность измерений (для большинства генов средний коэффициент R2 > 0.99), что позволяет получать точный профиль экспрессии генов и обнаруживать 0.5-кратное изменение экспрессии. Высокое соотношение «сигнал – шум» повышает чувствительность и воспроизводимость секвенирования.
Мультиплексные возможности системы генетического анализа GenomeLab GeXP и технология капиллярного электрофореза позволяют эффективно исследовать набор генов, используя всего 5-50 нг РНК
Программное обеспечение для системы генетического анализа GenomeLab GeXP контролирует все этапы высокопроизводительного анализа экспрессии генов: от подбора праймеров до управления исследованиями. Программное обеспечение GenomeLab eXpress Profiler позволяет легко разработать план анализа, включая быстрый автоматизированный подбор праймеров, построение схемы мультиплексной реакции и вычисление относительных значений экспрессии генов. Модуль eXpress Analysis идентифицирует информацию о фрагментах и объединяется с файлом исходных данных. Данные модуля eXpress Analysis можно импортировать в модуль eXpress Map для визуализации в виде изображения матрицы высокой плотности («тепловой» карты).
Секвенирование
Для секвенирования ДНК в системе генетического анализа GenomeLab GeXP используется линейный полиакриламидный гель, капилляры со специальным покрытием, соединения на основе дезоксиинозинтрифосфата и красители, излучающие в ближнем инфракрасном свете. Денатурация образца выполняется в системе генетического анализа автоматически. Использование секвенатора GenomeLab GeXP и наборов реагентов AB Sciex обеспечивает высокую чувствительность при определении меченых красителями продуктов реакции секвенирования, даёт возможность получать надёжный сигнал от секвенатора и контролировать условия электрофоретического разделения. Секвенатор осуществляет мультиплексный анализ фрагментов, анализ SNP, STR, AFLP и MLPA.
Преимущества системы генетического анализа GenomeLab GeXP
GenomeLab GeXP |
С двумя микропланшетами |
С одним микропланшетом |
Кат. № |
А26572 |
А62684 |
Капилляры |
Изолированный блок из 8 капилляров со специальным внутренним покрытием |
|
Гель |
Линейный полиакриламидный гель, поставляется в шприцах |
|
Формат планшетов для образца/буфера |
96-луночные микропланшеты |
|
Источники света |
2 диодных лазера первого класса опасности |
|
Детекция |
Флуоресценция на четырёх длинах волн |
|
Операционная система |
Win XP |
|
Система управления |
Два ПК с мониторами |
|
Габариты (ШхГхВ) |
61х66х94 см |
|
Вес |
81.6 кг |
|
Электроподключение |
11-240 В, 5 А, 50/60 Гц |